Manusia Kerdil di Manggarai karena Genetik dan Lingkungan

Keberadaan populasi orang pendek di desa-desa sekitar Liang Bua di Manggarai, Nusa Tenggara Timur, ternyata secara genetika tidak terkait dengan Homo floresiensis yang fosilnya ditemukan di gua Liang Bua.

Kompas

Kondisi goa Liang Bua, di Kecamatan Ruteng, Kabupaten Manggarai, Nusa Tenggara Timur, Rabu (9/62021). Di goa ini pernah ditemukan fosil manusia kerdil Homo floresiensis. Di desa-desa sekitarnya hingga saat ini masih bisa dijumpai manusia (Homo sapiens) pendek, tetapi riset oleh Lembaga Biologi Molekuler Eijkman menunjukkan tidak ada keterkaitan genetik di antara keduanya.

JAKARTA, KOMPAS — Kelainan genetik yang dipicu oleh adaptasi terhadap kondisi lingkungan menjadi faktor utama keberadaan orang pendek yang ditemukan di desa-desa sekitar Liang Bua, Kecamatan Ruteng, Kabupaten Manggarai, Nusa Tenggara Timur. Genom orang kerdil ini dipastikan tidak memiliki bauran dengan genetika manusia hobit purba Homo floresiensis yang fosilnya ditemukan di goa Liang Bua.

”Keberadaan populasi pendek atau pigmi modern (Homo sapiens) di desa dekat goa Liang Bua, tempat ditemukannya fosil Homo floresiensis atau hobit, telah lama menjadi tanda tanya. Apakah mereka memiliki kaitan genetik,” kata ahli genetika populasi Lembaga Biologi Molekuler Eijkman, Herawati Supolo Sudoyo, di Manggarai, Rabu (9/6/2021).

Menurut Herawati, selain di Manggarai, manusia kerdil juga ditemukan di Papua. Sementara di luar Indonesia bisa dijumpai di Afrika, Filipina, dan Andaman. ”Mitos warga sekitar Liang Bua menunjukkan adanya kaitan itu. Namun, riset kami memberikan hasil berbeda, manusia kerdil modern di Manggarai tidak terkait dengan Homo floresiensis,” katanya.

Kesimpulan tersebut diperoleh setelah tim peneliti Eijkman, bekerja sama dengan tim ilmuwan internasional, melakukan pengurutan dan menganalisis genom dari 32 orang kerdil dari Desa Rampasasa, di sekitar Liang Bua. Sebagian hasil penelitian ini telah dipublikasikan di jurnal Human Genomics pada 2018.

Baca juga: Jejak Hobit di Liang Bua

Serena Tucci, ahli evolusi biologi dari Princeton University, yang menjadi penulis pertama paper itu menyebutkan, analisis genomik ini menunjukkan tidak adanya keterkaitan genetik antara manusia kerdil modern dan Homo floresiensis. ”Tidak ada indikasi gene flow (aliran gen) dari hobit (Homo floresiensis) ke orang yang ada sekarang ini,” sebut Tucci dan tim.

Kajian arkeolog MJ Morwood di jurnal Nature pada 2004 menyebutkan, fosil Homo floresiensis di Liang Bua berumur sekitar 100.000 hingga 60.000 tahun lalu. Keberadaan mereka lebih awal dibandingkan dengan kedatangan manusia modern tertua di Indonesia yang jejaknya ditemukan di sejumlah daerah sekitar 50.000 tahun lalu.

Kompas

Salah satu warga bertubuh pendek dari Kampung Rampasasa, Ruteng, Kabupaten Manggarai, Nusa Tenggara Timur, Jumat (22/10), melihat kondisi situs Liang Bua yang menjadi lokasi penemuan fosil manusia purba. Sebagian warga Kampung Rampasasa memiliki tubuh kerdil dengan tinggi 130-145 sentimeter sehingga sering dikaitkan dengan penemuan fosil manusia purba yang juga berukuran kerdil.

Sebagai perbandingan, Homo floresiensis rata-rata memiliki tinggi 106 sentimeter (cm), sedangkan tinggi rata-rata orang kerdil di Rampasasa 145 cm.

Data lebih rinci tentang status antropometri, hematologi, biokimia dan endokrin pada populasi pigmi yang tinggal di Rampasasa dilaporkan Aman Pulungan dari Departemen Kesehatan Anak, Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia di Journal of Pediatric Endocrinology and Metabolism pada April 2021. Disebutkan, tinggi rata-rata untuk pria dewasa adalah 144,7 cm, sedangkan wanitanya  rata-rata 139,3 cm.

Mitos warga sekitar Liang Bua menunjukkan adanya kaitan itu. Namun, riset kami memberikan hasil berbeda, manusia kerdil modern di Manggarai tidak terkait dengan Homo floresiensis.

Seleksi alam dan evolusi

Menurut Herawati, tim peneliti juga membandingkan genom orang kerdil di Rampasasa dengan populasi lain. Hasilnya ditemukan orang Rampasasa memiliki bauran DNA manusia purba lainnya, yakni Neanderthal dan Denisovan, sebagaimana populasi lain di Asia Tenggara. ”Tidak ditemukan gen purba lain di luar Neanderthal dan Denisovan sehingga bisa dikatakan tidak ada aliran gen dari Homo floresiensis,” ujarnya.

Dari komposisi genetikanya, orang pendek di Manggarai ini memiliki bauran dari Asia Timur, Asia Tenggara, dan Oseanik (Papua). Mereka memiliki gen Papua 23,2 persen dan Denisovan 0,8 persen. Komposisi gen Denisovan mereka lebih tinggi dari rata-rata populasi di Asia Tenggara lainnya, tetapi lebih kecil dari rata-rata orang Papua yang sekitar 3 persen.

Baca juga: Misteri Homo Floresiensis

Komposisi genetika di Manggarai ini relatif sama dengan populasi lain di Nusa Tenggara Timur yang rata-rata juga memiliki bauran dengan Papua. Perbedaan manusia pendek di Manggarai dengan populasi modern lain hanya dalam gen yang berhubungan dengan tinggi badan dan makanan.

Tinggi badan diketahui merupakan sifat yang diwariskan. Ahli genetika telah mengidentifikasi banyak gen dengan varian tertentu yang berasosiasi dengan perawakan yang lebih tinggi atau lebih pendek.

KOMPAS/PRIYOMBODO

Homo floresiensis fossils at an archeological excavation in Liang Bua, North Rahong district, Manggarai Regency, East Nusa Tenggara, Saturday (3/8/2019). The excavation at Liang Bua is a continuation of the discovery of fossils of Homo floresiensis, a small relative of modern humans, at a depth of 6 meters in 2003. The Homo floresiensis fossils are estimated to be 50,000 to 190,000 years old.

Herawati mengatakan, analisis genomik yang dilakukan juga mengungkapkan bahwa perubahan evolusioner populasi di Manggarai sehingga menjadi kerdil berasosiasi dengan pola makan. Evolusi perawakan pendek pada orang kerdil Flores merupakan hasil seleksi alam yang bekerja pada variasi genetik yang sudah ada sebelumnya.

”Ada bukti seleksi pada gen untuk enzim yang terlibat dalam metabolisme asam lemak yang disebut dengan enzim FADS (asam lemak desaturase). Gen-gen ini telah dikaitkan dengan adaptasi diet pada populasi lain, termasuk Inuit di Greenland,” kata Herawati.

Temuan ini juga menunjukkan bahwa pernah ada peristiwa di masa lalu yang dialami oleh leluhur orang pendek di Rampasasa ini yang menyebabkan pola makan mereka berubah secara dramatis. Perubahan ini diadaptasi oleh seleksi alam yang mendukung varian tertentu dari gen-gen itu.

Untuk mengetahui peristiwa alam itu di masa lalu, menurut Herawati, diperlukan studi lebih lanjut dan multidisiplin, termasuk  ilmu lingkungan dan geologi untuk memahami evolusi yang khas di pulau kecil. Selain temuan fosil manusia hobit, di sekitar Liang Bua dan Lembah Soa, Kabupaten Ngada,  juga ditemukan fosil stegodon kerdil.

Sebaliknya, di beberapa pulau kecil di sekitar Flores ditemukan komodo, reptil terbesar. Selain itu, di Flores juga ditemukan tikus raksasa (Papagomys armandvillei) dengan panjang tubuh hingga 45 cm.